বজ্রপাত মূলত বায়ুমণ্ডলের ট্রপোমণ্ডল স্তরেই ঘটে। পৃথিবীর পৃষ্ঠ থেকে প্রায় ৮-১৮ কিলোমিটার পর্যন্ত বিস্তৃত এই স্তরটি আবহাওয়া সম্পর্কিত সব ঘটনার কেন্দ্রবিন্দু। মেঘ, বৃষ্টি, ঝড়, তুষারপাত ও বজ্রপাত সবকিছুই এই স্তরেই সংঘটিত হয়।

ট্রপোমণ্ডলে বাতাসের ঘনত্ব তুলনামূলক বেশি এবং এখানেই জলীয় বাষ্পের পরিমাণ সর্বাধিক। সূর্যের তাপে ভূপৃষ্ঠ উষ্ণ হলে নিচের দিকের হালকা উষ্ণ বাতাস ওপরে উঠে যায় এবং ওপরের ঠান্ডা ভারী বাতাস নিচে নামে। এই উল্লম্ব বায়ু চলাচলের ফলে বড় বড় কিউমুলোনিম্বাস মেঘ তৈরি হয়, যা বজ্রপাতের জন্য সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ।

এই মেঘের ভেতরে বরফকণা, পানিকণা ও ধূলিকণার সংঘর্ষের ফলে ধনাত্মক ও ঋণাত্মক বৈদ্যুতিক চার্জ আলাদা হয়ে যায়। একপর্যায়ে চার্জের পার্থক্য এত বেশি হয় যে হঠাৎ করে বৈদ্যুতিক নির্গমন ঘটে, যাকে আমরা বজ্রপাত হিসেবে দেখি। বজ্রপাতের সঙ্গে সাধারণত প্রচণ্ড শব্দ (বজ্রধ্বনি), ভারী বৃষ্টি ও ঝোড়ো হাওয়া দেখা যায়- যা ট্রপোমণ্ডলের স্বাভাবিক বৈশিষ্ট্য।

অন্যদিকে, স্ট্রাটোমণ্ডল, মেসোমণ্ডল ও তাপমণ্ডল স্তরে আবহাওয়াজনিত এমন কোনো সক্রিয় প্রক্রিয়া নেই। এসব স্তরে জলীয় বাষ্প খুব কম এবং উল্লম্ব বায়ু চলাচলও সীমিত, ফলে বজ্রপাত ঘটার উপযোগী পরিবেশ সেখানে তৈরি হয় না।

সুতরাং, বৈজ্ঞানিকভাবে নিশ্চিতভাবে বলা যায় যে বজ্রপাত ট্রপোমণ্ডল স্তরেই ঘটে।