বাণিজ্যিক ব্যাংকগুলোকে তাদের মূলধনের নির্দিষ্ট অংশ কেন্দ্রীয় ব্যাংকে জমা রাখতে হয়। যেহেতু জনতা ব্যাংক একটি বাণিজ্যিক ব্যাংক, তাই এই ব্যাংকের মূলধনের নির্দিষ্ট অংশ বাংলাদেশ ব্যাংকের কাছে জমা আছে।