১৯৬৮ সালের জানুয়ারি মাসে তৎকালীন সরকার বঙ্গবন্ধু শেখ মুজিবুর রহমানকে প্রধান আসামি করে মোট ৩৫ জন বাঙালি সামরিক ও বেসামরিক ব্যক্তির বিরুদ্ধে রাষ্ট্রদ্রোহীতার অভিযোগে মামলা দায়ের করে। ইতিহাসে এ মামলা ঐতিহাসিক "আগরতলা মামলা" নামে পরিচিত। ১৯৬৬ সালের ৬ দফাভিত্তিক বাঙালির জাতীয় জাগরণকে চিরতরে নস্যাৎ করার জন্য পাকিস্তানি শাসকগোষ্ঠী বিভিন্ন পন্থা অবলম্বন করে। ছয় দফা আন্দোলনের জন্য রাষ্ট্র 'রাষ্ট্রদ্রোহিতার' অভিযোগে অভিযুক্ত ও দেশরক্ষা আইনে আটক শেখ মুজিবুর রহমানকে ঢাকা কেন্দ্রীয় কারাগার থেকে ১৯৬৮ সালে ১৭ই জানুয়ারি বেকসুর খালাস প্রদান করলেও ১৮ই জানুয়ারি গেটের বাইরে পা রাখার সাথেই তাকে 'পাকিস্তান আর্মি, নেভী এবং এয়ারফোর্স এ্যাক্ট'-এ গ্রেপ্তার করে কেন্দ্রীয় কারাগার থেকে কুর্মিটোলা সেনানিবাসে নিয়ে যাওয়া হয়। এ মামলার আনুষ্ঠানিক নাম ছিল "রাষ্ট্র বনাম শেখ মুজিবুর রহমান ও অন্যান্য।"